通过转录组学和代谢组学（GC-MS非靶向代谢组学）对BPF暴露和对照组的细胞进行分析，筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析，找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析，揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式，发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变，揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题：转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象：人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：7.963发表时间：2021年11月合作单位：上海交通大学附属新华医院运用生物技术：GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学、qRT-PCR非靶向代谢组学 土壤非靶代谢学 非靶脂质组学研究。上海质 代谢组学

GC-MS非靶向代谢组：随着纳米材料的产业化,各种形式的纳米材料将以不同途径进入人们的生活,纳米材料的生物安全性问题正受到世界各国科学家的***关注，本篇为2020年2月，南京大学环境学院课题组在Environmental Science & Technology杂志（IF=9.028）发表题为“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究论文。该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合，提供了对AgNPs生态影响的全新视角，***了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。标题：银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱期刊：EnvironmentalScience&Technology影响因子：9.028发表时间：2020年2月合作单位：南京大学环境学院运用生物技术：16SrRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组（由鹿明生物提供技术支持）。北京代谢组学中药代谢组学-对生物体内所有代谢物进行定量分析。

LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究案例，中文标题：使用无偏差代谢组学方法鉴定短期暴露于颗粒物和微生物气溶胶中的青年人尿液生物标志物研究对象：年轻健康志愿者发表期刊：EnvironmentalPollution影响因子：8.071发表时间：2022年4月17日合作单位：中国医学科学院医药生物技术研究所卫计委***生物工程重点实验室、中国中医科学院广安门医院运用生物技术：LC-MS代谢组学、GC-MS代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法探索 92 名年轻健康个体的尿液代谢组学特征，并确定与短期共暴露相关的潜在生物标志物。

LC-MS靶向代谢组+16S微生物多样性检测研究。题目：粪便微生物可以区分酒精性肝炎引起的酒精摄入量，但不能区分疾病的严重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*样本类型：人粪便*检测平台：LC-MS靶向代谢组、16S微生物多样性检测为了表征酒精性肝炎有关的粪便微生物生态学，考察微生物组变化和疾病严重程度的关系，推断微生物生态学变化的功能相关性，本文作者将中度或重度酒精性肝炎患者（MAH和SAH）的粪便微生物组与健康（HC）和重度饮酒对照组（HDC）进行比较，通过16SrRNA基因测序鉴定微生物群分类，使用LC/MS平台测量粪便短链脂肪酸（SCFA）含量。重度饮酒患者与健康对照组相比、重度饮酒组与酒精性肝炎相比，均可以发现明显的微生物组特征分布。但微生物分类不能区分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中，粪便中短链脂肪酸与产生SCFA的微生物菌群均减少，可以推断出，酒精性肝炎患者的粪便微生物组有明显的变化，与酒精性肝炎的严重程度无关。代谢组学-鹿明生物-欧易生物 以生物体内所有代谢产物为研究对象。

双平台代谢组学研究，2022年4月，鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果，通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法，发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物，并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献，为署名作者。代谢组学,代谢组数据库,代谢组分析,基因检测。浙江代谢组学 英文

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微生物16S rRNA测序+代谢组学研究：标题：EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠粪便、脑组织*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍（ASD）是一种发育障碍，目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明，肠道菌群与ASD发展之间存在联系，但肠道菌群与ASD的脑功能障碍（肠脑轴）联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因（位于7q号染色体，属于受体酪氨酸激酶Eph家族），因基因突变和在ASD患者中表达下调，被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关，并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺，调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层（mPFC）（关键的肠脑功能轴）的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。上海质 代谢组学

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